Elle est réunie tous les ans à l'occasion du congrès de l’IISA, elle fixe les orientations des travaux de l'Institut et détermine les modalités d'action de ses services. Elle approuve le budget et arrête les comptes.

Les membres de l'Assemblée générale sont les représentants des Etats, des sections nationales, des organisations internationales ainsi que des membres collectifs qui se réunissent sous la direction du président de l'IISA.